La circolazione dei treni è regolare tra Flaminio e Saxa Rubra e tra Montebello e Civitacastellana/Viterbo; tutti i treni extraurbani arrivano e partono da Montebello. Fanno eccezione quattro corse: nei feriali alle 4.45 da Civitacastellana per piazzale Flaminio e alle 20.26 (e non alle 20.45) da piazzale Flaminio per Civitacastellana; nei festivi alle 8.30 da piazzale Flaminio per Sant'Oreste e alle 17.42 da Viterbo per piazzale Flaminio. Queste quattro corse extraurbane effettuano servizio normale, ma tra Saxa Rubra e Montebello (e viceversa) non effettuano fermate intermedie.